L'ensemble des bonus cachés présentés se trouvent sur le second disque de l'édition collector.
La femme en rouge
Entrez dans le menu Bonus puis placez-vous sur un des sujets présentés. Cliquez alors vers la droite. Une femme en rouge apparaît de dos derrière Morphéus. Validez et accédez à un petit making-of de 45s sur cette fameuse créature tout de rouge vêtue...
L'agent Smith
Restez sur le menu précédent et refaite une pression sur la touche droite de votre télécommande. L'agent Smith prend alors la place de la femme en rouge, toujours derrière Morphéus. Validez et accédez à un petit sujet de 1mn 33s sur les problèmes de santé de l'acteur pendant son entraînement.
La poursuite finale
Entrez cette fois dans la deuxième page des bonus. Placez-vous sur une des lignes puis cliquez à droite. Néo change alors de position. Validez et découvrez un petit making-of d'une durée de 2mn 39s sur la poursuite finale et le face à face de Néo avec les 3 agents.
Le Juke-Box
Allez dans le menu Langue. Placez-vous sur un sous-titre dans la liste de gauche puis cliquez à gauche. Un petit combiné téléphonique apparaît en surbrillance. Validez puis sur la page qui s'affiche alors, choisissez Juke-Box. 41 morceaux de musique, répartit sur plusieurs pages, vont sont proposés.
Bande-annonce
Placez-vous sur le deuxième écran du juke-box (chansons de 11 à 20) puis cliquez à droite pour faire apparaître un second "Bullet-Time FX" en bas de l'écran à droite. Vous accéderez alors à une bande-annonce inédite (en VO, 4/3) de Matrix avec un logo détourné, comme sur le film original.
